UCADceraas BIOINFORMATICS
Sesamum indicum Genetic Discovery Database (SiGeDiD)
Gene ID
LG
mRNA sequence
Peptide sequence
function predicted
SIN_1008102
1

 - ATGGAAAACGACGCCAAGCTACCGCCCGACCATAAACTCTGCGGTTACCT ATGTGCCGTTCTCACAGCTCCGGCGGACGCCTCCTCCTCCATTCCCCTCA ACTCTCTCTGCAGCATTGGCGGCGAACCCCCAAATGTTTACTTCGCCACC CAAAGCGACGTTCGCCTGACCCCCATCGGCAAGCCGGAATCTTGCGATTC CAATGCCACGCCGTCTGTCAAGAAGCGTTGGAGCAGAATTGGGATGGTCC ACGGATCGATTAGCGTGGTGCACCAGCTGCACGCCCTCGTAACGCACAAG TGCTTGAAAATTGTGGCCCGAATCACGAGGATTTTGCCACACAGGACAGA GGCCGAGTGTGGAAGCAGGGAAGTTAGGGCTGTGGTGCTGGTGGATGTGT ACTTGCCGACAGATTTGTGGTCTGGTTGGCAGTTCCCGCGGTCGAGCTCC GTTGCTGCCGCTCTTTTCAAACACTTAAGCTGTGATTGGGAAGCTAGAGG CTTGATGCTGAAGTCTGTCAAATTGGATGGTGATGATTATTATAGCATTT GGAGTGTAACGGACTGTCACGTCCTTGGCTGTAGATGGCATTGTAGTGCA CCTGACAATCTTAAGAAGAAAAAGCTTTTTGAACTCCAGGAAATTTTTAA GAGCTTACCCTGCGTGACAAAGAAGGTGGACTGTGATGATTCAAGAGTAA AACCAGCAGTCTCATCGTGTGAATCTGGTATCTGGGTGCTGTCAGATGAT ATTTTGATTAATATTTTAACTATACTAAGCCCAATTGACCTTGTTAAGAT TTCATTGGCGTGCCGTCATTTAAGGTTCTTGGCAGCATCCATCATGCCAT GCATGAAGCTTAAACTTTATCCTCATCAGCAGGCTGCAGTTGAGTGGATG TTACAGCGTGAGAAGGACTGTAAAGTCCTAAAACATCCCCTGTGTATGAA TTTCAGGACCGAAGATGGTTTTGATTTTAATATCAATGTGGTTTCTGGTG AAATTGTTGCTGGTATAGTTCCTACAATTAGGGATTTTCGTGGTGGAATG TTCTGTGATGAACCTGGATTGGGTAAGACTATCACTGCTATCTCTCTTAT TCTGAAGACACAAGGAACCTTGGCAGAACCACCAGATGCAGTACAAGTGA TCTGGTGTATGCATGATGGGAATCAGAGGTGTGGCTATTATGAAGCGCGT GCTGACAAAATAACTAAGGGTAATGTGTCTAGTATGAAGAACATTTTGGG TCATAAAACTCGGAGGGGACAATTATGTCTAGATGAACTCACCCCAAAAA GGATTTGTAGTGGCTACGAGTCAAAGTCACCCTGGCCTCTTGTTTCCAGG GAGCAAATAGTGGAACCCACTGATTCATGTTCTAACAAAACAATTAAATT GTGTGAACCTGCATGCTCAACACCTGCAACTATCAGTATGCAGTCCAGCA GGAGCTGGAGTAATGCGAGGAGAAATCTTCTAGCTGCGTATAAGGAGCCA TCTTTTACCTCTGAGAGATGCTCAAAGAATAGGAAGCACGCCTCTAATGA CAAACAAAGGTCTCGGGGTAACCAAGTTGGTTTGGCCTGCAGGATATCAT TGACTAGGAAGAGGGATAAGGAGACAGTAACAGACGATCTTGAATATAAT GAAACTTGGGTCCAGTGTGATGCTTGTAGCAAGTGGCGGAAGGTTGCAGA TGGATGTTTAGCGAATACTTCCAGAGCATGGTTTTGTAGTATGAATGGTG ACCCCTCTTACCAGAGTTGTAATGTTCCTGAAGAATCCTGGGATTGTAGG GAGCCTATCACATACCTACCAGGCTTCCACGCCAAGGGGTCCTCTGGGGG TCAGGAGGAGAACATATCATTTTTCATTGGAGTGCTAAAGGACCACTATA CATTGCTCAATTCTGAGACAAAGAAAGCCTTGATGTGGCTGGCTAAACTT TCACCAGGTAAGCTTGCAGAAATGGAAACAATTGGGTTAGTGAGCCCGAT CGTAGGGACCTCCCTATTTGATACGAGAGTTGCTCGTGATTATCACAAAA TATTTCAAGCATTTGGCCTTATAAAAAAAGTGGAAAAGGGTGTTTTGAGG TGGTACTATCCCAAGAGTCTTGTGAACCTGGCCTTTGACTTGAATTCCCT TAGGATTGCTCTCTGTGAGCCATTAGACTCGCTGAGGTTGTATTTGTCAA GTGCAACTTTGATTGTTGTCCCTTCAAATCTTGTTGATCACTGGAGGACT CAGATTGAAAGGCATGTTAGACCAGGTCAGTTGAGAGTCTATATATGGGG TGATCAAAAGAAAAAGCCTTCTGGTCACTGTTTGGCTTGGGACTATGATG TTGTAATAACTACCTTCAATCGTTTGAGTGCTGAGTGGGGGCCCCGTAAA AGAAGCGTACTAATGCAAGTTCATTGGCTTAGGGTCGTGTTGGATGAGGG GCATACTCTTGGCTCAAGTCTCAGTTTGACAAACAAATTGCAAATGGCAG TGTCACTAACTGCCACTAACCGCTGGTTGTTGACAGGTACGCCAACTCCC AATACTCCTAACAGTCAGCTATCTTATCTTCAACCCATGCTAAAGTTCCT CAAAGAAGAGACTTATGGCCAACATCAGAAATCATGGGAAGCAGGTATCC TAAGGCCATTTGAGGCAGAGATGGAAGAGGGCAGGTCGCGCTTGCTGCAG TTGCTTAACAGATGCATGATTAGTGCAAGGAAAATAGATCTGAAAGCAAT CCCACCTTGCATAAAAAAGATAACATTTGTGGATTTTTCAGAAGAACATG CAAAAAGTTACAATGAGTTGGTAGAAACAGTTAGGCGTAATATTTTGATG GCGGACTGGAATGATTCGTCTCATGTTGAGAGTTTATTGAACCCAAAACA ATGGAAATTTCGAGCTACGACTATAAAAAATGTGAGGTTATCCTGCTGTG TGGCTGGACATGTCAGAGTAACAGATGCTGGCCAAGATATTCAAGAAACT ATGGATATTCTAGTAGATAATGGTCTGGATCCTGCGTCAGAGGAGTATGC TTTTGTAAAGTACAGTCTCTTGCATGGTGGCAATTGTATGAGGTGCAGAG AATGGTGTCGTTTACCCGTCATTACACCTTGTAGGCATCTATTATGCCTT GATTGTGTTGCTTTAGACAGTGAAAGGTGTACATTTCCTGGTTGTGGTAA CTCATATGAAATGCAAAGTCCAGAAGAATTAGCTCGTCCAGAGAATCCTA ATCCTAAGTGGCCTGTGCCAAAGGATCTCATTGAGTTACAGCCTTCATAT AAGCAGGATGACTGGAATCCTGATTGGCAGTCAACATCCAGCAGCAAAGT TACATATCTAGTTCGCCGGTTAAAAGAATTGCAGGAAATGAATAGGACAA TTGGGTATGGAGACAAGAGAGAGGTTATCTCTAATGAACTTAATTTCTCC TCTAACAGGAGTTATTTCCACATATCACTGGATCAGGAGGCTTGCAATAA AGCCAGAAATGAGGGGAGCCATGTACCTTCTGAGAAAGTTATTATTTTTT CACAGTTTCTTGAGCATATCCATGTCATCGAACAGCAGTTGGGTATAGCT GGTATCCAATTTGCCGGAATGTATAGTCCCATGCACTCTATTAATAAGAT GAAATCCCTAGCAACTTTCCAGCATGATGCAAATTGTATGGCTCTCTTGA TGGATGGAAGTGCAGCATTAGGTCTTGATTTAAGCTTTGTGACTCGTGTC TATCTAATGGAACCTATATGGGATAGAAGCATGGAGGAGCAGGTGATTAG TCGTGCTCATCGAATGGGTGCTGCACGTCCCATTCATGTGGAGACATTAG CAATGACTGGCACAATCGAAGAGCAAATGTTGAAATTTTTACAGGATGGT GATGAATGCAGAAGGTTCTTGAAGGAAGAATTTGGTACAAATGGTCTTGA CGGGACACGGTCATTTCGCACATTACATGATTTTGCTGAGAGCAATTACT TGACTCACCTTAGTTTTGTGCGCACCAGCTCCACGATAGAACAGCTGGAT AAGTTATAA

standard] MENDAKLPPDHKLCGYLCAVLTAPADASSSIPLNSLCSIGGEPPNVYFAT QSDVRLTPIGKPESCDSNATPSVKKRWSRIGMVHGSISVVHQLHALVTHK CLKIVARITRILPHRTEAECGSREVRAVVLVDVYLPTDLWSGWQFPRSSS VAAALFKHLSCDWEARGLMLKSVKLDGDDYYSIWSVTDCHVLGCRWHCSA PDNLKKKKLFELQEIFKSLPCVTKKVDCDDSRVKPAVSSCESGIWVLSDD ILINILTILSPIDLVKISLACRHLRFLAASIMPCMKLKLYPHQQAAVEWM LQREKDCKVLKHPLCMNFRTEDGFDFNINVVSGEIVAGIVPTIRDFRGGM FCDEPGLGKTITAISLILKTQGTLAEPPDAVQVIWCMHDGNQRCGYYEAR ADKITKGNVSSMKNILGHKTRRGQLCLDELTPKRICSGYESKSPWPLVSR EQIVEPTDSCSNKTIKLCEPACSTPATISMQSSRSWSNARRNLLAAYKEP SFTSERCSKNRKHASNDKQRSRGNQVGLACRISLTRKRDKETVTDDLEYN ETWVQCDACSKWRKVADGCLANTSRAWFCSMNGDPSYQSCNVPEESWDCR EPITYLPGFHAKGSSGGQEENISFFIGVLKDHYTLLNSETKKALMWLAKL SPGKLAEMETIGLVSPIVGTSLFDTRVARDYHKIFQAFGLIKKVEKGVLR WYYPKSLVNLAFDLNSLRIALCEPLDSLRLYLSSATLIVVPSNLVDHWRT QIERHVRPGQLRVYIWGDQKKKPSGHCLAWDYDVVITTFNRLSAEWGPRK RSVLMQVHWLRVVLDEGHTLGSSLSLTNKLQMAVSLTATNRWLLTGTPTP NTPNSQLSYLQPMLKFLKEETYGQHQKSWEAGILRPFEAEMEEGRSRLLQ LLNRCMISARKIDLKAIPPCIKKITFVDFSEEHAKSYNELVETVRRNILM ADWNDSSHVESLLNPKQWKFRATTIKNVRLSCCVAGHVRVTDAGQDIQET MDILVDNGLDPASEEYAFVKYSLLHGGNCMRCREWCRLPVITPCRHLLCL DCVALDSERCTFPGCGNSYEMQSPEELARPENPNPKWPVPKDLIELQPSY KQDDWNPDWQSTSSSKVTYLVRRLKELQEMNRTIGYGDKREVISNELNFS SNRSYFHISLDQEACNKARNEGSHVPSEKVIIFSQFLEHIHVIEQQLGIA GIQFAGMYSPMHSINKMKSLATFQHDANCMALLMDGSAALGLDLSFVTRV YLMEPIWDRSMEEQVISRAHRMGAARPIHVETLAMTGTIEEQMLKFLQDG DECRRFLKEEFGTNGLDGTRSFRTLHDFAESNYLTHLSFVRTSSTIEQLD KL

IPR000330; SNF2-related IPR001650; Helicase, C-terminal IPR011124; Zinc finger, CW-type IPR014001; DEAD-like helicase IPR017907; Zinc finger, RING-type, conserved site